第220回農林交流センターワークショップ「植物科学・作物育種におけるフェノーム解析-はじめて画像解析を行う研究者のための入門実習-」(9/3~4開催、茨城)
2019-06-26
近年、先端的工学技術の生物研究への応用が急速に進んだことで、共通の性質を持つ生体分子の情報を大量かつ高感度に取得する網羅的分子生物学研究が可能になりました。一方で、多様な対象を扱う表現型の大規模解析(フェノーム)においては、特定の技術の汎用的利用が困難であり、個々の研究者のニーズに対応した解析方法の開発が不可欠です。
この度、農林水産省農林水産技術会議事務局 筑波産学連携支援センター及び国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構の主催により、植物を対象とした顕微鏡から圃場までの様々なレベルのフェノーム研究を講義により紹介するとともに、パソコンで操作できるフリーソフトを使った画像解析について、初心者を対象とした実習を行い、フェノーム解析の一端を体験するワークショップが開催されますので、お知らせいたします。
日時
令和元年9月3日(火)~9月4日(水)
場所
農林水産技術会議事務局 筑波産学連携支援センター
情報共同通信利用館(電農館) 3階 セミナー室 (茨城県つくば市観音台2-1-9)
主催
農林水産省農林水産技術会議事務局 筑波産学連携支援センター
国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構
対象
産学官の試験研究機関の研究者
講義・実習内容
◆9月3日(火) 10:00~17:15
【挨拶】農林水産省農林水産技術会議事務局 筑波産学連携支援センター コーディネーション推進課長 荒川 智幸 氏
【講義】「画像解析の始め方: サンプリング、観察、撮影条件の検討と撮像」
朽名 夏麿 氏(エルピクセル株式会社)
【実習】「ImageJ を使った画像解析実習: インストールとサンプルデータのダウンロード 前半」
榊原 章之 氏(エルピクセル株式会社)
【実習】「ImageJ を使った画像解析実習: インストールとサンプルデータのダウンロード 後半」
朽名 夏麿 氏(エルピクセル株式会社)
【実習】「ImageJ を使った画像解析実習: ファイルの入出力、関心領域(ROI)の指定」
榊原 章之 氏(エルピクセル株式会社)
【実習】「ImageJ を使った画像解析実習: 補正・前処理・2値化・領域抽出」
朽名 夏麿 氏(エルピクセル株式会社)
【実習】「ImageJ を使った画像解析実習: 数・形態・分布の解析」
榊原 章之 氏(エルピクセル株式会社)
【実習】「ImageJ を使った画像解析実習:色彩の定量的解析」
朽名 夏麿 氏(エルピクセル株式会社)
◆9月4日(水) 9:15~16:00
【実習】「ImageJ を使った画像解析実習: 多量のデータに対する処理の自動化」
朽名 夏麿 氏(エルピクセル株式会社)
【講義】「自動フェノタイピングシステムRIPPSの開発と植物の環境応答解析」
藤田 美紀 氏(理化学研究所)
【講義】「ディープラーニングによる画像解析」 大下 真弘 氏(ITAGE株式会社)
【講義】「農業AI研究での画像認識技術の適用例」 竹谷 勝 氏(農研機構 農業情報研究センター)
【講義】「ドローンリモートセンシングの基礎」 坂本 利弘 氏(農研機構 農業環境変動研究センター)
【フリーディスカッション】 全講師
【実習】「受講者の画像サンプルを使った具体的な解析法の例示」 全講師
詳細
申込方法や日程等、詳細は農林水産省 農林水産技術会議事務局 筑波産学連携支援センターホームページをご覧ください。